Храм во имя святых мучеников Флора и Лавра в селе Яган-Докья относится к православным храмам Удмуртской Республики. Святые Флор и Лавр, пострадавшие за веру во II веке в Иллирике, особо почитались на Руси как покровители домашнего скота, особенно лошадей. Их память совершается 18 (31) августа.
История почитания этих святых на русских землях восходит к древним временам. Согласно преданию, с обретением их мощей прекратился падеж скота, что способствовало распространению их почитания среди земледельческих и скотоводческих общин. В иконографии святые традиционно изображаются с лошадьми, что отражает их народное почитание как защитников этих животных.
Точная дата основания храма в селе Яган-Докья документально не установлена. Архитектурные особенности здания позволяют отнести его к типовым постройкам сельских православных храмов конца XIX - начала XX века. В этот период на территории Удмуртии велось активное церковное строительство, связанное с миссионерской деятельностью среди местного населения.
В советский период храм, как и многие другие культовые сооружения, вероятно, был закрыт. Возрождение церковной жизни произошло в конце XX века, когда начался процесс возвращения религиозных зданий Русской Православной Церкви. Реставрационные работы позволили восстановить исторический облик храма и возобновить в нем богослужебную деятельность.
Архитектура храма характерна для сельского церковного зодчества своего времени. Здание выполнено в традициях русско-византийского стиля с элементами местного колорита. В декоративном убранстве фасадов прослеживаются черты, характерные для православных храмов Уральского региона.