Строительство храма велось с 2013 по 2017 год и было завершено летом 2017 года.
Инициатива строительства храма возникла в связи с необходимостью духовного окормления жителей правобережной части Красноярска. 16 июня 2013 года митрополит Красноярский и Ачинский Пантелеимон освятил поклонный крест и закладной камень на месте будущего храма. В строительстве приняли участие около 70 предприятий, организаций и частных благотворителей. Храм был построен исключительно на средства меценатов.
Архитектурный проект храма разработан архитектором Владимиром Терсковым. Здание построено в стиле раннехристианских базилик и рассчитано на 500 прихожан. На цокольном уровне располагаются помещения под трапезную, воскресную школу и кабинеты священнослужителей.
Храм святого Феодора Тирона стал центром Свято-Никольского комплекса, который включает в себя также храм-памятник жертвам политических репрессий, рассчитанный на 50–60 человек, звонницу, иконную лавку, воскресную школу, ризницу и хозяйственные помещения.
Небесным покровителем храма выбран великомученик Феодор Тирон — древнеримский воин, принявший смерть за исповедание веры во Христа в годы языческих гонений. Храм призван стать памятником воинам всех времён, положивших душу свою за други своя.
До строительства основного храма на территории комплекса находилась временная деревянная церковь во имя святого Феодора Тирона, построенная между 1996 и 1997 годами. Первая служба в ней была совершена 20 декабря 1997 года. В настоящее время здание временного храма не действует и используется как свечная и иконная лавка.
