Село Апанасенковское, ранее известное как Митрофановское, было основано в 1783 году на территории урочищ Хамхулты и Соку. Название села было дано в честь святителя Митрофана Воронежского, что свидетельствует о глубокой религиозной приверженности первых поселенцев. В 1875 году в селе был построен молитвенный дом, а впоследствии — деревянная церковь, освящённая в честь святителя Митрофана. К 1897 году село насчитывало 360 дворов и 400 домов, с населением около 2850 человек.
В 1935 году село было переименовано в Апанасенковское в честь уроженца села, советского военачальника И. Р. Апанасенко. В этот период, как и во многих других регионах СССР, религиозная деятельность подвергалась ограничениям, что привело к закрытию и разрушению многих храмов. Однако конкретные сведения о судьбе храма святителя Митрофана в этот период отсутствуют.
В постсоветский период началось возрождение религиозной жизни в селе. Был построен новый храм в честь святителя Митрофана Воронежского по адресу: улица имени Книга, 29. Архитектурные особенности храма включают традиционные элементы православного храмостроительства, соответствующие каноническим требованиям. При храме действует воскресная школа, что свидетельствует о продолжении духовно-просветительской деятельности.