Согласно исследованиям краеведа А. Г. Бобова, поселение возникло на реке Белая Плота, правом притоке Северского Донца, рядом с хуторами Рындинка и Шипы.Основными переселенцами были солдаты «государевой посопной» и рейтары волости Белгородского уезда.В 1668 году село упоминается под названием «Плоское Дмитриевой тож».
В 1660-х годах в Плоте была построена первая деревянная Дмитриевская церковь, являвшаяся самой первой на территории современного Прохоровского района. В 1809 году эта церковь сгорела. В 1906 году на её месте была возведена новая одноглавая церковь во имя святого великомученика Димитрия Солунского. Храм был построен из дерева и обложен кирпичом. К 1885 году в селе насчитывалось 96 дворов, а в 1886 году проживало 769 человек.
В период коллективизации, в 1926 году, в селе появился первый колхоз, а в 1933 году были образованы колхозы «Свободный труд» и «Луч революции». В 1963 году в Плоте были построены магазин и пекарня, а в 1973 году началось строительство домов для жителей колхоза и был проведен водопровод.
В 2009 году в селе был построен новый православный храм в честь святого великомученика Димитрия Солунского, ставший одной из главных достопримечательностей Плоты. В декабре того же года был открыт современный магазин, который стал своеобразным культурным центром для небольшого села. В здании Плотавской средней общеобразовательной школы также расположены историко-краеведческий музей и библиотека.
