Первоначальная Богоявленская церковь была построена в конце XVII — начале XVIII века на высоком мысу, что обеспечивало защиту от наводнений и хороший обзор реки. Это было время начала принятия христианства кочевыми народностями, что способствовало их этнокультурному сближению с русскими. С момента возникновения храма в Хатанге службу совершали иеромонахи Свято-Троицкого Туруханского монастыря, преодолевая более тысячи километров тяжелого пути в течение нескольких недель, они приходили ежегодно к Рождеству и оставались здесь до Святой Пасхи. В конце XIX века священнослужители стали оставаться на постоянную службу.
Во времена СССР храм использовали как жилой дом и парикмахерскую, а в 1971 году он был снесён. В начале 1990-х годов началось восстановление храма в Хатанге, которое полностью было завершено к 2001 году. 19 августа 2001 года, в праздник Преображения Господня, храм был освящён архиепископом Красноярским и Енисейским Антонием.
Архитектурно храм представляет собой деревянное здание, выполненное в традиционном русском стиле. Он имеет четырёхскатную крышу, увенчанную главкой с крестом, и небольшое крыльцо перед входом. Внутреннее убранство храма включает иконостас и иконы, соответствующие православной традиции.
В настоящее время храм Богоявления Господня продолжает функционировать, являясь центром духовной жизни для жителей села Хатанга и окрестных населённых пунктов. В храме регулярно проводятся богослужения, включая Божественные литургии, молебны и другие церковные обряды, в соответствии с уставом Русской Православной Церкви.
