Первоначально на этом месте в 1778 году была построена деревянная церковь при активном участии помещика Крешкина.К середине XIX века эта церковь обветшала, и в 1861 году на её месте была возведена новая каменная церковь.
В XIX веке село Подоклинье принадлежало помещикам Бороздиной и Тутолмину и имело отношение к Бешковицкой крепости.
Архитектурно храм представляет собой одноапсидный, бесстолпный и пятиглавый храм с ярко выраженным крестовым планом, окончания которого выполнены в виде прямоугольников. Главный объём храма ориентирован с юга на север. Центральная часть представляет собой повышенный четверик, к которому с востока примыкает алтарь, а с запада — трёхъярусная колокольня. Световой барабан восьмигранный с небольшими оконными проёмами, увенчан луковичной главой. По углам четверика расположены четыре декоративных восьмигранных барабана с аналогичными главками. Фасады украшены лопатками, соединёнными аркатурными поясами, повторяющими пощипцовое покрытие. Оконные проёмы апсиды и притвора имеют арочные перемычки с килевидными сандриками.
Внутреннее убранство храма сохранилось в хорошем состоянии. Двухъярусный иконостас украшен резьбой мастерского исполнения. Особую ценность представляет икона Богоматери «Отрада», привезённая в храм с Афона в 1861 году.
В советский период храм, вероятно, подвергся закрытию, как и многие религиозные учреждения того времени. Однако конкретные сведения о его использовании в этот период отсутствуют.
В постсоветское время здание храма было возвращено Русской Православной Церкви. 10 декабря 1999 года была зарегистрирована местная религиозная организация — Православный приход храма Богоявления села Подоклинье Порховского района Псковской области Псковской епархии Русской Православной Церкви (Московский Патриархат).
