Храм Богоявления Господня в селе Новый Некоуз был возведен в 1873 году как зимний храм прихода села Николо-Замошье, которое позднее вошло в состав районного центра. Первоначально храмовый комплекс включал также летнюю Успенскую церковь, построенную в 1807 году и разобранную в 1932 году по распоряжению властей для нужд строительства районного центра.
Церковь имеет три престола: главный — во имя Богоявления Господня, боковые — в честь Покрова Пресвятой Богородицы и Владимирской иконы Божией Матери. Строительство храма осуществлялось на средства местной общины, особый вклад внесла Иулиания Львова, дочь временного городского купца, пожертвовавшая более 10 тысяч рублей. По данным 1881 года, интерьер храма отличался искусно отделанными иконостасами под золото с иконами в серебряных ризах, стены и своды были украшены изящной живописью.
Архитектурный облик представляет собой небольшое одноглавое здание, соединенное с трехъярусной колокольней из красного кирпича. Территория храма окружена кладбищем с чугунной оградой и каменными вратами, где погребены настоятели и подвижники благочестия.
В советский период храм не закрывался, несмотря на разрушение соседней Успенской церкви. В 1990-е годы часть колокольни была повреждена молнией, начаты восстановительные работы. В тот же период проведено обновление фресок. В 2013 году после реконструкции пола совершено великое освящение храма епископом Рыбинским и Угличским Вениамином.
Среди святынь храма — иконы с частицами мощей благоверных князей Георгия Владимирского, Василия Ростовского, Петра и Февронии Муромских, а также икона «Неопалимая купина» XIX века. Особо почитается память священномученика Димитрия Вознесенского, служившего в храме и расстрелянного в 1918 году.