Первые упоминания о церковной жизни в селе Тихие Горы (ныне в составе г. Менделеевска) относятся к 1722 году, когда здесь существовала деревянная церковь в честь Казанской иконы Божией Матери, принадлежавшая Седмиозерной пустыни. К 1799 году в селе функционировали два деревянных храма: холодная Богоявленская церковь (освящена в 1763 году) и теплая Михаило-Архангельская (построена в 1751 году), которые впоследствии были разобраны по ветхости.
Каменный трехпрестольный Богоявленский храм был возведен в 1825-1828 годах на народные средства в стиле позднего классицизма. Центральный престол в честь Богоявления Господня освящен в 1835 году, правый придел в честь Казанской иконы Божией Матери - в 1821 году, левый во имя святого Архистратига Михаила - в 1818 году. В административном отношении приход до 1791 года входил в Казанскую епархию, затем перешел в Вятскую.
В 1898-1903 годах по проекту архитектора А. Лихачева проведена реконструкция храма, в ходе которой была расширена холодная часть, устроена гробница для погребения представителей купеческой династии Ушковых (основателей местного химического производства) и смонтирована система калориферного отопления. В 1930 году храм был закрыт советскими властями, использовался как клуб, мельница и складское помещение.
Возрождение храма началось в 1990 году с регистрации православной общины. Первое богослужение совершено 19 января 1991 года в престольный праздник. В 2001 году архиепископ Казанский и Татарстанский Анастасий освятил главный престол. В храме имеются частицы мощей святых, включая мученицу Татиану, праведного Прокопия Устьянского и святителя Луку Крымского.