В 1993 году митрополит Ростовский Владимир (Котляров) благословил основание нового прихода в честь Азовской иконы Божией Матери. Выбор названия подчеркивал стремление увековечить память о православных жителях Азова и значимых деятелях города. Для проведения богослужений был переоборудован бывший кинотеатр «Дон», где после ремонта начали собираться прихожане.
С 1996 года начались работы по проектированию нового храма. В 1998 году строительство было официально начато, освящение строительного места совершил архиепископ Ростовский Пантелеимон. Строительство затянулось до 2005 года, что связано с необходимостью привлечения дополнительных ресурсов и средств. Для ускорения процесса был создан Попечительский совет, в который вошли депутаты Азовской городской думы и руководители местных предприятий. По инициативе казачьего руководства храм получил статус полкового.
В 2006 году работы продолжились: были возведены стены и установлены купола. Общая высота церкви с куполами составила около 30 метров. Храм был спроектирован таким образом, чтобы одновременно вмещать до 300 человек.
В марте 2007 года в колокольню был установлен полутораметровый колокол «Князь Владимир» весом 1270 кг. Он был отлит в Каменске-Уральском и преподнесен в дар храму губернатором Свердловской области В.Ф. Чубом. Весной того же года в храме была совершена первая Божественная литургия.
В период с 2008 по 2009 годы в храме проводились внутренние отделочные работы, пополнялся иконостас новыми образами, обустраивалась прилегающая территория. Эти усилия направлены на создание комфортной и духовно насыщенной обстановки для прихожан.