Храм Архангела Михаила в селе Низовка был первоначально построен в 1775 году как деревянный холодный храм на средства прихожан. Престолы были освящены во имя Архистратига Божия Михаила и святителя Николая Чудотворца. Храм обнесен деревянной оградой. Церковная земля включала усадебную и пахотную, часть доходов с которой делилась между храмом и причтом.
В 1822 году храм был перестроен. По данным на 1900 год, причт состоял из священника и псаломщика. Приход включал село Низовка и деревню Чукалаху, насчитывая 150 дворов с общей численностью прихожан 1203 человека. Церковно-приходское попечительство действовало с 1882 года, а школа открыта в 1885 году.
Храм сохранил статус действующего в советский период. Архитектурные особенности здания не описаны в сохранившихся источниках, но известно, что он оставался центром духовной жизни села. В настоящее время храм продолжает функционировать, сохраняя исторические престолы: главный — во имя Архангела Михаила, придельные — во имя святителя Николая Чудотворца и мучеников Флора и Лавра.