Село Нижнее Санчелеево было основано в начале XVIII века как мордовское поселение в низовьях реки Соколки. Название села происходит от личного имени «Санчелей» с добавлением указания на его расположение в нижней части реки, в то время как в верховьях существовало село с названием Верхнее Санчелеево. Изначально территория была покрыта густыми лесами, которые постепенно вырубались для нужд строительства и отопления, что приводило к обмелению реки, но способствовало развитию и укреплению села.
В 1843 году в селе был построен деревянный храм во имя Архангела Михаила. Спустя 44 года, в 1887 году, на его месте была возведена каменная церковь. К 1897 году Нижнее Санчелеево насчитывало около 200 дворов. После Октябрьской революции 1917 года церковь была закрыта, а её имущество изъято. В 1931 году здание храма было закрыто, а в декабре 1932 года разобрано; кирпич был продан местным жителям, а колокола с колокольни, всего шесть, сданы на металлолом для нужд индустриализации. Священник и дьякон с семьями были сосланы.
В годы Великой Отечественной войны жители села активно защищали Родину. В их память был установлен памятник погибшим воинам. Один из уроженцев села, Иван Дмитриевич Бузыцков, был удостоен звания Героя Советского Союза. Ещё один земляк, Виктор Николаевич Кувшинов, после тяжёлого ранения научился писать и рисовать, держа карандаш между пальцами ног, и стал инженером-конструктором.
После войны в селе функционировал колхоз. К 2022 году в Нижнем Санчелеево проживало около 3000 человек. В селе были школа, детский сад, магазины, больница с дневным стационаром, дом культуры, библиотека и почта.
Спустя 79 лет после разрушения, в 2010 году, в Нижнем Санчелеево был вновь открыт храм во имя Архангела Михаила. Инициативная группа во главе с бывшей главой сельского поселения Ниной Фёдоровной Трутневой обратилась к благочинному Ставропольского округа Самарской епархии с просьбой об открытии храма. В 2011 году был зарегистрирован приход, и настоятелем был назначен иерей Владимир Сюкарев. При поддержке местных жителей и предпринимателей было проведено оборудование и реконструкция помещения, а также приобретена необходимая церковная утварь и купол. В престольный день, 21 ноября 2011 года, была совершена первая Божественная литургия.
В 2012 году настоятелем храма стал иерей Александр Филонов, который прослужил в этой должности девять лет. В 2016 году на средства благодетелей было построено здание воскресной школы, где дети получают знания о православной вере. В 2017 году была возведена звонница с шестью колоколами и электронным звонарём. 27 октября 2019 года епископ Нестор освятил новые крест и купол на храм. 25 сентября 2021 года состоялось архиерейское богослужение, которое возглавил епископ Нестор.
