Село Малые Ясырки было основано около 1710 года выходцами из соседнего села Большие Ясырки, которые, столкнувшись с нехваткой земельных ресурсов, переселились на новое место. В 1866 году на средства местных жителей в селе была возведена деревянная церковь во имя Архангела Михаила, ставшая центром духовной жизни общины.
Архитектурно храм представляет собой деревянное здание, обшитое тёсом, выполненное в русском стиле. В плане сооружение имеет форму креста, включающего собственно храм, небольшую трапезную и колокольню. Основной объём храма — однокупольный четверик с пятигранной апсидой, высотой 15 метров, увенчанный главкой. Двухъярусная колокольня с шатровой крышей достигает высоты 20 метров и завершается небольшой главкой. Проект храма соответствует образцовому проекту деревянной церкви № 19, рассчитанному на вместимость от 450 до 500 человек.
К 1884 году церковь имела в своём распоряжении 33 десятины земли и два подцерковных деревянных дома. Штат причта состоял из одного священника с денежным окладом 420 рублей. К 1900 году число прихожан составляло 859 человек.
В июне 1906 года звон колоколов церкви послужил сигналом к началу крестьянских волнений в Бобровском уезде. В память об этом событии один из малых колоколов церкви экспонируется в Государственном центральном музее современной истории России.
В 1930 году, в ходе антирелигиозной политики советской власти, храм был закрыт и использовался как зернохранилище. Однако 23 января 1945 года богослужения в церкви были возобновлены. После войны при храме сформировалась женская монашеская община, состоявшая из монахинь закрытых монастырей и освободившихся из мест заключения.
В настоящее время здание храма находится в неудовлетворительном состоянии и нуждается в срочном ремонте. В 2024 году были проведены работы по ремонту церковного колодца и часовни над ним, а также начаты мероприятия по реставрации колокольни.