Село Долгое, находящееся на берегу реки Дон, впервые упоминается в окладной книге 1676 года как населённый пункт с церковью во имя Архистратига Михаила.В то время в приходе числилось 73 двора детей боярских и 24 двора бобыльских, всего 101 двор, включая 4 двора причта.
В 1781 году была выдана храмозданная грамота на перестройку обветшавшей деревянной церкви. К 1782 году строительство новой каменной церкви было завершено, и 28 ноября того же года иерей Алексей Григорьев с причтом и прихожанами ходатайствовали о её освящении с выдачей нового антиминса, поскольку предыдущий, датированный 1601 годом, пришёл в негодность.
В 1861 году первоначальные колокольня и трапезная были разобраны, и на их месте в 1865 году возведены более просторные сооружения. От первоначального здания сохранились объёмы прямоугольной в плане трапезной с тремя световыми осями и квадратный в плане первый ярус колокольни. Фасады трапезной украшены филенчатыми лопатками по углам, а центральные оси северного и южного фасадов венчаются трёхчастными аттиками с полуциркульным завершением. Оконные проёмы прямоугольные с полуциркульным завершением, декорированы рамочными наличниками с профилированными архивольтами. Первый ярус колокольни на северном, западном и южном фасадах имеет ложные круглые слуховые окна.
В начале XX века село Долгое являлось центром Долговской волости Данковского уезда Рязанской губернии. В 1906 году в селе насчитывалось 231 двор.
В советский период храм был закрыт, и его здание использовалось не по прямому назначению. В 2004 году начались работы по восстановлению храма, и он был вновь открыт для богослужений. Здание храма является памятником архитектуры.
