Каменный храм во имя Архистратига Михаила в селе Чечеры был возведен в 1868 году на средства прихожан. Первоначально церковь являлась приписной к Троицкому храму села Большой Хомутец и обслуживалась его клиром: настоятелем священником Иосифом Павлевским, двумя помощниками - священниками Семеном Делицыным и Василием Волченским, а также тремя псаломщиками.
По данным 1869 года, приход насчитывал 545 душ мужского пола и 617 женского. Церкви принадлежало 33 десятины пахотной и сенокосной земли. Церковным старостой с 1869 года состоял государственный крестьянин Маликов. Храм относился к 4-му Лебедянскому-Добринскому благочинническому округу Тамбовской епархии.
В 1893 году в документах епархии упоминается Богословский придел. К этому времени храм получил собственный штат: священника Симеона Никитовича Делицына (71 год, рукоположен 3 апреля 1843 года), диакона и псаломщика Николая Аристарховича Аристархова (24 года). При храме действовала школа грамотности с 39 учениками.
Согласно историко-статистическому описанию 1911 года, каменный храм имел холодный основной объем и теплую трапезную. Престолов было два: главный - во имя Архангела Михаила и придельный - во имя апостола и евангелиста Иоанна Богослова. Приход был открыт в 1768 году. В селе насчитывалось 199 дворов, 682 души мужского пола и 723 женского. В состав прихода входила деревня Чибизовка, расположенная в 7 верстах от храма.
В советский период храм был закрыт в 1930-х годах, колокола сброшены. Богослужения не совершались более 80 лет. В 2012 году начались ремонтно-восстановительные работы, которые продолжаются по настоящее время. Сохранились фрагменты первоначальной росписи на штукатурке.