Село Нижнее Село, расположенное на правом берегу реки Пышмы, известно с конца XVII века. В XVIII веке здесь была построена первая деревянная церковь, посвященная Архангелу Михаилу. В 1786 году началось строительство нового деревянного храма, а в 1796 году заложен каменный храм. В 1810 году освятили придел в честь мученицы Параскевы, а в 1822 году главный храм освятили в честь Архангела Михаила. В 1864 году вокруг храма построена каменная ограда с железной решёткой.
В 1934 году колокольный звон был запрещён, а в 1935 году храм закрыт постановлением президиума облисполкома. С 1941 года в здании размещался детский дом, а с 1935 по 1965 год — средняя сельская школа. После 1965 года здание использовалось как складские помещения.
В 1991 году приход был вновь открыт, и с 1993 года начались восстановительные работы. Был отремонтирован придел во имя мучеников Флора и Лавра, и возобновлены регулярные богослужения. В 2012 году установлены новые купола.
Архитектура храма является ярким примером эклектики. Он представляет собой трёхпрестольную каменную церковь с тремя приделами и шестью куполами. Колокольня состоит из четырёх ярусов и завершается восьмёриком с куполом и шпилем. Внутри храм перекрыт четырёхлотковым сомкнутым сводом, а трапезная соединена с приделами широкими арками.