Село Щербинка известно с XVII века. В 1628 году в приходных окладных книгах Патриаршего казенного приказа упоминается деревянная церковь во имя святых князей Бориса и Глеба. В 1680 году в дозорных книгах церковь значится в вотчине князя Юрия Ивановича Ромодановского, а священником был Гавриил Родионов.
В 1734 году был издан указ о строительстве новой деревянной церкви на месте ветхой. Строительство завершилось в 1735 году, и церковь была освящена. В 1785 году на средства графини Екатерины Ивановны Головкиной была построена новая каменная церковь во имя святых Бориса и Глеба. Архитектурно храм представляет собой крестчатое сооружение с высоким восьмериком, перекрытым сомкнутым сводом. Колокольня была пристроена с западной стороны.
В 1858 году к колокольне с восточной стороны был пристроен дополнительный алтарь, а в нижнем ярусе разместился храм Рождества Пресвятой Богородицы. В 1896 году рядом с церковью было построено здание церковно-приходской школы.
В советский период храм подвергся значительным изменениям. Верхняя часть колокольни была снесена, а здания храмов были объединены в одно строение, использовавшееся как склад. В результате внутреннее убранство было уничтожено или утрачено.
