Первое упоминание о храме в селе Лобаново относится к 1627 году, когда здесь существовала деревянная церковь во имя Рождества Пресвятой Богородицы. В 1750 году на средства прихожан и местного помещика началось строительство каменного храма, которое завершилось в 1755 году. Архитектурно храм представлял собой одноапсидное здание с трапезной и колокольней, выполненное в стиле барокко.
В 1860 году по проекту архитектора М. Д. Быковского храм был перестроен. В ходе реконструкции были добавлены новые архитектурные элементы, что придало зданию черты эклектики. Фасады были украшены плоскостным декором, пилястрами и рамочными наличниками с клинчатыми замковыми камнями.
В 1930-е годы, в период антирелигиозной политики, храм был закрыт. Здание использовалось под хозяйственные нужды, что привело к утрате многих элементов внутреннего убранства и архитектурных деталей.
В 1990-е годы храм был возвращён Русской Православной Церкви. Начались восстановительные работы, направленные на реставрацию утраченных элементов и возобновление богослужебной деятельности. К 2000 году регулярные службы были возобновлены.
