Первое упоминание о деревне Яковлево относится к 1678 году, когда она значилась за Алексеем Терентьевичем Возницыным. В 1705 году деревня перешла к его сыну, Андрею Алексеевичу Возницыным, и насчитывала 12 дворов.
В 1862 году жители деревни Яковлево и близлежащих населённых пунктов обратились к епархиальной власти с просьбой перенести из Покровского погоста деревянную церковь, которая после строительства там каменного храма оставалась бездействующей. Получив разрешение, в 1864 году они перенесли и собрали двухэтажную пятиглавую церковь на новом месте, и в 1865 году освятили её: нижний престол — в честь Покрова Пресвятой Богородицы, верхний — в честь Ахтырской иконы Божией Матери.
Ахтырская икона Божией Матери, которой был посвящён верхний престол, является местной святыней. По преданию, она была явлена у источника возле деревни Федотово, расположенной неподалёку от Яковлево. На месте её обретения в 1865 году была построена деревянная часовня, куда трижды в год совершались крестные ходы из Яковлевского храма.
В 1892 году при храме была открыта церковно-приходская школа, в которой в 1895 году обучались 86 учеников. К концу XIX века Ахтырский придел не вмещал всех желающих.
В 1915 году, при финансовой поддержке владельца села, купца Бахова, и стараниями настоятеля отца Димитрия Левкоева и старосты храма В. И. Галкина, был выстроен новый просторный храм, способный вместить до 1000 человек. Этот храм сочетал в себе архитектурные элементы эклектики и был украшен пятью главами.
В конце 1930-х годов, в период гонений на церковь, оба храма в Яковлево были закрыты и подверглись разорению. Деревянная церковь была разобрана, а каменный храм использовался как склад для хранения удобрений, что привело к утрате многих архитектурных элементов и внутреннего убранства.
В 1995 году, благодаря усилиям общины Иоанно-Богословского храма из Ликино-Дулёво, началось возрождение церковной жизни в Яковлево. Были инициированы восстановительные работы в Покровском храме, направленные на возвращение ему первоначального облика и возобновление богослужений.
В настоящее время Ахтырский храм в Яковлево является действующим. Богослужения в нём совершаются регулярно в выходные и праздничные дни. При храме возобновлены традиции проведения крестных ходов к святому источнику Ахтырской иконы Божией Матери, расположенному возле деревни Федотово. Этот источник известен уже на протяжении трёх веков и почитается верующими за свои исцелительные свойства.
