В 1809 году в селе Залужное была построена каменная Казанская церковь, ставшая центром религиозной жизни местных жителей. Однако в советский период храм был закрыт и впоследствии разрушен, оставив верующих без места для богослужений.
К концу 1990-х годов возникла инициатива по строительству нового храма для возрождения духовной жизни в селе. Поначалу будущие прихожане собирали средства по домам селян, затем к проекту присоединились местные предприниматели и руководители предприятий района и области. Значительный вклад в строительство внес наместник Свято-Успенской Святогорской Лавры епископ Арсений.
Новый двухэтажный храм был возведен и 22 октября 2006 года митрополит Воронежский и Борисоглебский Сергий совершил его освящение и первую Божественную литургию. Верхний храм был освящен в честь Живоначальной Троицы, а нижний — в честь Казанской иконы Пресвятой Богородицы, в память о ранее существовавшей Казанской церкви.
Архитектурно храм представляет собой кирпичное пятиглавое двухэтажное здание с шатровой колокольней. Комплекс окружен зданиями воскресной школы, богадельни и дома причта, также имеющими шатровые главки. В составе комплекса имеется шатровая водосвятная часовня, построенная во второй половине 2010-х годов.