Раздольненский Иннокентиевский монастырь был образован в 2000 году как приход в селе Раздольное Биробиджанского района Еврейской автономной области. Инициатором создания выступил священник, приобретший для этой цели дачный участок с домом, который был переоборудован под храм. В 2007 году приход был преобразован в женский монастырь по решению Священного Синода Русской Православной Церкви.
21 августа 2007 года Священный Синод утвердил открытие монастыря и назначил его первую настоятельницу. 15 октября того же года обитель была официально зарегистрирована. Главный храм монастыря, освященный во имя святителя Иннокентия Московского, был построен на основе переоборудованного жилого дома. В 2008 году состоялось освящение деревянного храма, а в 2014 году был завершен каменный сестринский корпус.
Монастырь имеет подсобное хозяйство, занимается производством свечей, выпечкой просфор и хлеба. В 2017 году на территории обители был освящен источник в честь святителя Иннокентия. В 2020 году приход в селе Двуречье был преобразован в скит монастыря.
Монастырь является единственной женской обителью в Биробиджанской епархии. Его деятельность включает богослужения, социальную работу и миссионерское служение в регионе. Архитектурный ансамбль монастыря включает храмы, сестринские корпуса и хозяйственные постройки.