В 1995 году в деревне Малая Дубна была зарегистрирована православная община. По благословению митрополита Крутицкого и Коломенского Ювеналия был совершен чин закладки на месте строительства будущего Преображенского храма. Строительство велось на фундаменте недостроенного здания местной администрации, переданного районными властями в дар Церкви.
С 2000 по 2003 годы строительство было приостановлено, и богослужения проводились в домовой церкви при местном детском садике. В 2003 году работы воз возобновлены благодаря поддержке ЗАО «Славянский пух», местных попечителей, администрации и прихожан. В короткий срок был возведен деревянный храм в традициях средневекового русского зодчества. Восьмеричный купольный барабан и колокольню увенчали шатры. После возведения стен были проведены внутренние работы: настил полов, прокладка электричества и отопления, конопатка швов и установка иконостаса.
16 ноября 2008 года храм Преображения Господня был освящен архиепископом Можайским Григорием. В настоящее время при храме действует воскресная школа для детей школьного возраста, где изучаются основы православной веры, история церкви, Ветхий и Новый заветы, Закон Божий и жития святых. Занятия открыты для участия родителей учеников.
Богослужения совершаются регулярно в выходные и праздничные дни. Храм открыт для посещения во время богослужений. Актуальное расписание доступно на официальном сайте храма.