Мужской монастырь святых Царственных Страстотерпцев был учреждён 28 декабря 2000 года по благословению Святейшего Патриарха Московского и всея Руси Алексия II и решению Священного Синода. Монастырь расположен в урочище Ганина Яма, где в июле 1918 года были уничтожены останки членов Царской семьи и их верных слуг. Строительство монастыря началось после визита Патриарха Алексия II 23 сентября 2000 года, когда он благословил создание обители на этом месте.
Первый храм монастыря — в честь святых Царственных Страстотерпцев — был заложен 1 октября 2000 года и освящён 27 декабря того же года. В период с 2000 по 2003 год на территории монастыря было построено и освящено ещё шесть деревянных храмов: преподобного Серафима Саровского, преподобного Сергия Радонежского, иконы Божией Матери «Иверская», иконы Божией Матери «Державная», святителя Николая Мирликийского Чудотворца и праведного Иова Многострадального. Количество храмов соответствует числу членов Царской семьи.
Центральным местом монастыря является шахта № 7, куда были сброшены останки Царской семьи. Шахта огорожена галереей, вдоль которой установлены лампадки. Рядом с шахтой находится Поклонный крест из морёного дуба, связанный с историей Великой Отечественной войны. В 2000 году Царская семья была канонизирована Русской Православной Церковью в лике святых Страстотерпцев.
Монастырский комплекс выполнен в традициях русского деревянного зодчества. Архитектурный ансамбль включает также музей, трапезную, игуменский корпус и другие хозяйственные постройки. Территория монастыря является местом паломничества и проведения ежегодных памятных мероприятий, связанных с историей Царской семьи.