Инициатива строительства храма возникла в начале 2000-х годов, когда жители Краснознаменска выразили потребность в собственном православном храме. Проектирование и строительство храма были осуществлены с учетом традиций русского церковного зодчества. Храм представляет собой строение высотой 33 метра и состоит из двух этажей, где размещаются верхний и нижний храмы. Над внутренним убранством Михаило-Архангельского храма трудились мастера со всей России: из Подмосковья, Воронежа, Ростова, Тулы. Вокруг храма обустроена парковая зона, на территории которой высажено более 400 деревьев.
30 октября 2016 года митрополит Крутицкий и Коломенский Ювеналий совершил великое освящение Михаило-Архангельского храма и возглавил Божественную литургию в новоосвященном храме.
С момента освящения храм стал центром духовной жизни города. При храме действует воскресная школа, где дети и взрослые получают религиозное образование, изучают основы православной веры и участвуют в различных культурных мероприятиях. Духовенство активно участвует в культурно-патриотических мероприятиях Краснознаменского гарнизона.
Храм также активно участвует в благотворительной деятельности, оказывая помощь нуждающимся и поддерживая социальные проекты.
