Первое упоминание о храме относится к XIV веку, когда на этом месте существовала деревянная церковь. В 1700 году на её месте был возведён каменный храм. В 1828 году митрополит Филарет благословил перестройку храма, проект которой в стиле ампир разработал архитектор Фёдор Михайлович Шестаков. Четверик храма равен по высоте и ширине трапезной, образуя с ней единый внешний объём. Четверик выделен боковыми портиками с фронтонами и завершён массивной ротондой, перекрытой полусферическим куполом с люкарнами, отличающейся особой нарядностью и совершенством обработки.
В советское время, с 1930-х годов и до 2007 года, в здании церкви находился городской Краеведческий музей. В 2007 году храм был передан верующим, началась реставрация, и в мае того же года в храме начались богослужения. 21 ноября 2008 года, в праздник Михаила Архангела, храм был торжественно освящён митрополитом Крутицким и Коломенским Ювеналием.
В настоящее время Михаило-Архангельский храм является действующим, в нём регулярно проводятся богослужения. Храмовые праздники отмечаются 21 ноября и 19 сентября.
