В XIII веке на территории современного подворья находилось княжеское село Крутицы, расположенное на возвышенном левом берегу Москвы-реки. В 1261 году, по инициативе князя Александра Невского, в столице Золотой Орды Сарай-Бату была учреждена православная Сарская епархия для духовного окормления русских, находившихся под властью Орды. В 1272 году, при сыне Александра Невского, князе Данииле Московском, Сарская епархия основала своё подворье в Крутицах, тогда же был освящён первый храм во имя святых апостолов Петра и Павла.
В 1454 году, в связи с упадком Золотой Орды и уменьшением значения Сарая, епископ Вассиан перенёс кафедру из Сарай-Бату в Крутицы, что ознаменовало начало нового этапа в истории подворья. К середине XVI века крутицкие епископы получили сан митрополитов, став ближайшими помощниками московских первосвятителей. В 1612 году, во время польско-литовской интервенции, когда кремлёвские соборы были захвачены, Успенский собор на Крутицах стал фактически кафедральным храмом московского православия.
В XVII веке под руководством митрополита Павла III на подворье развернулось масштабное строительство. В 1650 году началось возведение пятиглавого Успенского собора с шатровой колокольней. В 1680–1690-х годах, по проекту зодчего Осипа Старцева, был построен Крутицкий теремок — надвратная палата, украшенная разноцветными изразцами. В этот период также были возведены Митрополичьи палаты, Воскресенская церковь и другие сооружения, сформировавшие уникальный архитектурный ансамбль подворья.
В XVIII веке, после упразднения патриаршества и реформ Петра I, значение Крутицкого подворья снизилось. В 1788 году Крутицкая епархия была упразднена, а территория подворья передана военному ведомству. В последующие годы здания подворья использовались под казармы и другие военные нужды, что привело к частичной утрате и разрушению исторических построек.
В XIX веке предпринимались попытки реставрации и сохранения подворья. В 1838 году, по указу будущего императора Александра II, начались восстановительные работы Воскресенской церкви. Архитекторы Евграф Тюрин и Константин Тон внесли значительный вклад в реставрацию и перестройку храмовых сооружений. Однако, несмотря на эти усилия, к началу XX века общее состояние подворья оставалось неудовлетворительным.
После революции 1917 года храмы Крутицкого подворья были разграблены, а богослужения прекращены. В 1925 году Успенский собор передали под общежитие Московского военного округа. В 1930-х годах Воскресенскую церковь перестроили под жилой корпус. В послевоенные годы начались реставрационные работы под руководством архитектора Петра Барановского, однако полноценное восстановление комплекса затянулось на десятилетия.
В 1991 году, после распада СССР, Крутицкое подворье было возвращено Русской Православной Церкви и получило статус Патриаршего подворья. В 1992 году в Воскресенском храме состоялось первое за многие десятилетия богослужение. С тех пор на территории подворья ведутся восстановительные работы, направленные на возрождение его духовной и культурной жизни.
Архитектурный ансамбль Крутицкого подворья включает в себя ряд уникальных памятников. Собор Успения Пресвятой Богородицы, построенный в XVII веке, отличается пятиглавием и шатровой колокольней. Митрополичьи палаты представляют собой образец гражданской архитектуры XVII века. Крутицкий теремок, украшенный изразцами работы мастера Степана Полубеса, является ярким примером декоративного искусства того времени. Воскресенская церковь, корпус митрополичьих приказов и другие сооружения дополняют этот ансамбль, создавая уникальный историко-архитектурный комплекс.
