Казанский Богородичный мужской монастырь в Тамбове основан во второй половине XVII века. Первое письменное упоминание относится к 1666 году, когда иеромонах Иосиф подал челобитную царю Алексею Михайловичу с просьбой о строительстве церкви. В 1679 году монастырю были пожалованы мельницы на реках Студенец и Цна, а также земли близ села Донского, Троицкой Дубравы и других территорий.
С 1758 года монастырь стал резиденцией тамбовских епископов. Епископ Пахомий (Симанский) построил деревянные архиерейские покои, консисторию и другие здания. В 1791 году началось каменное строительство: заложена летняя церковь Казанской иконы Божией Матери, освящённая в 1796 году. Храм возведён по образцу Успенского собора Саровской пустыни. В 1793 году здесь был рукоположен в иеромонахи преподобный Серафим Саровский.
В 1794 году заложена зимняя церковь Иоанна Предтечи, освящённая в 1821 году. Архитектурный ансамбль формировался под руководством епископа Феофила (Раева), при котором также построены каменные келейные корпуса, ограда с башнями и другие сооружения. В XIX веке монастырь стал центром епархиальной жизни: здесь проводились хиротонии, духовный суд и другие церковные дела.
В 1918 году монастырь закрыт советской властью. На его территории размещались лагерь для участников Антоновского восстания, губернская ЧК, архив и другие учреждения. Колокольня, некрополь и часть построек были уничтожены. Возрождение обители началось в 1992 году. В 2007 году завершена реставрация Казанского храма, в 2014 году построена новая колокольня высотой 107 метров.