Спасо-Преображенский собор в Губкине был возведен в период с января 1993 года по август 1996 года. Инициатива строительства принадлежала руководству ОАО «Лебединский ГОК» во главе с генеральным директором Анатолием Калашниковым. Проект разработан архитектором В. Смуровым и инженером Е. Ивлевой. В строительстве участвовали специалисты из России, Украины, Белоруссии, Чехии и Греции.
26 сентября 1996 года собор был освящен Святейшим Патриархом Московским и всея Руси Алексием II. Храм пятипрестольный: главный алтарь освящен во имя Спаса Преображения, в нижнем храме находится алтарь во имя Святителя Анатолия, Патриарха Константинопольского. Приделы верхнего храма посвящены священномученику Онуфрию, архиепископу Старооскольскому, и Песчанской иконе Божией Матери. В крестильном храме устроен придел во имя Всех Святых, в земле Российской просиявших.
Для колокольни собора голландской фирмой «Петит и Фритцен» изготовлено 11 колоколов, самый крупный из которых весит 6,2 тонны. В храме находится особо почитаемая икона Божией Матери «Помощь в родах», освященная в Новгороде в XVII веке. В 2014 году в собор перенесен ковчег с частицами мощей святителя Иоасафа Белгородского, Кипрских святых и других угодников Божиих.
В ноябре 2004 года начата настенная роспись верхнего храма, выполненная коллективом художников под руководством Александра Работнова. Росписи посвящены земной жизни Спасителя, событиям Ветхого и Нового Заветов. Внутреннее убранство дополнено резьбой по дереву, кафедрой работы софринских мастеров.
С 2000 года в соборе совершаются общеепархиальные богослужения с участием духовенства Белгородской митрополии. В июне 2012 года указом Святейшего Патриарха Кирилла храму присвоен статус кафедрального собора Губкинской епархии.
