В 2002 году, по благословению митрополита Крутицкого и Коломенского Ювеналия, на месте разрушенной в советские годы Иоанно-Предтеченской часовни и прилегающего к ней источника был установлен и освящён поклонный крест. Святой Иоанно-Предтеченский источник расположен на реке Работня, где ранее находилась деревня Рупасово, упоминаемая в летописях XV века. До 1980 года жители Рупасово пользовались чистейшей родниковой водой, которая имела необычный вкус. Вода в роднике была голубого цвета, так как проходила через слои голубой глины. С началом строительства Олимпийского проспекта деревню Рупасово снесли.
Строительные работы по возведению храма начались при участии строительной организации ЗАО «ВестСтрой». Заказчиком выступила Местная религиозная организация православный приход Успенского храма деревни Витенёво Мытищинского района. Архитектором проекта стал Вячеслав Ижиков. Источник расчистили и благоустроили трудами прихожан мытищинских храмов и неравнодушных жителей города Мытищи.
В 2013 году строительство храма было завершено, и он был освящён в честь святого Иоанна Предтечи. Архитектурно храм представляет собой традиционное православное сооружение с элементами русского стиля, гармонично вписывающееся в окружающий ландшафт. Храм стал духовным центром для местных жителей, где проводятся регулярные богослужения, а также различные мероприятия, направленные на укрепление православной веры и культуры.