Храм в честь Архистратига Михаила в селе Сергеево Шуйского района Ивановской области был построен в 1730-1732 годах стремянным конюхом Михаилом Ивановичем Марковым на территории собственной усадьбы. Первоначально храм являлся приходской церковью села Воскресенское-Сергеево (современное название - Сергеево). Каменная одноглавая церковь с ярусной колокольней выполнена в архитектурных традициях XVIII века.
В 1834 году храм подвергся значительной перестройке, изменившей его первоначальный облик. В 1880-х годах церковь была вновь перестроена, когда село Сергеево стало центром женской религиозной общины. После основания в 1889 году Воскресенско-Феодоровского женского монастыря храм Архангела Михаила вошел в состав монастырского комплекса.
В 1929 году, после закрытия монастыря советской властью, храм был переоборудован под ремонтные мастерские. В этот период были утрачены многие элементы внутреннего убранства. Здание возвращено Русской Православной Церкви в 1994 году в составе всего монастырского комплекса, который в 1998 году был возрожден как мужская обитель.
Архитектурно храм представляет собой характерный образец сельской приходской церкви первой половины XVIII века, перестроенной в XIX столетии. Композиция здания включает основной объем, завершенный одной главой, и пристроенную колокольню. В декоративном оформлении фасадов прослеживаются элементы барокко, характерные для церковного зодчества данного периода.
Исторически храм был связан с усадебной жизнью помещиков Марковых, а позднее - Шубиных. Основательница Воскресенско-Феодоровского монастыря Александра Николаевна Шубина была похоронена у стен Михаило-Архангельского храма. В храме сохранились некоторые элементы первоначального убранства, включая фрагменты росписей XIX века.