История храма Усекновения главы Иоанна Предтечи в Саратове связана с селом Ивановский Увек, вошедшим позднее в городскую черту. Первая деревянная церковь на этом месте была построена в 1746 году на средства посадского И. И. Потапова и освящена в 1748 году. В 1815 году на её месте возвели каменный храм с колокольней и тремя престолами: главным в честь Усекновения главы Иоанна Предтечи, правым во имя Архистратига Михаила и левым во имя святых апостолов Петра и Павла. Храм был построен тщанием саратовского прокурора Василия Максимова.
Церковь располагалась на возвышенности, рядом находился источник. К храму были приписаны окрестные населённые пункты: Набережный Увек, Александровка, Трещиха, Екатериновка и другие. При церкви имелись сторожка, школа грамоты (с 1889 года), преобразованная в 1899 году в церковно-приходскую школу, и приходское попечительство (с 1893 года). В штате причта состояли два священника, диакон и два псаломщика.
В советский период храм был закрыт в рамках антирелигиозной кампании и впоследствии разрушен. В начале XXI века община верующих была возрождена. Для богослужений временно приспособили кирпичное здание 1928 года постройки. 2 марта 2013 года по благословению митрополита Саратовского и Вольского Лонгина здесь был совершён чин положения Антиминса и первая Божественная литургия. В 2017 году в храме установили новый иконостас.