Первая церковь в селе Инкино была построена в 1804–1808 годах из разобранной деревянной церкви, перенесенной из юрт Иванкиных. Это сооружение стало первым православным храмом в данном населенном пункте. В 1862 году здание церкви было полностью перестроено, что свидетельствует о развитии прихода и увеличении численности местной православной общины.
В 1911 году на месте прежних построек возвели новую, третью по счету церковь. Данное сооружение продолжало традиции деревянного зодчества, характерные для храмового строительства в Сибири. Архитектурные особенности этого здания не сохранились в документальных источниках, однако факт его строительства указывает на устойчивость православной традиции в данном регионе в начале XX века.
История храма в советский период не документирована в доступных источниках. Отсутствие сведений о его состоянии в 1920-1930-е годы характерно для многих провинциальных храмов России. Современный статус здания и характер богослужебной жизни прихода также не отражены в открытых исторических материалах.