Первые упоминания о храмовом комплексе в селе Воронье относятся к началу XVII века. В писцовых книгах 1620 года значится деревянная церковь во имя святых страстотерпцев Бориса и Глеба, находившаяся во владении боярина князя Ивана Семёновича Куракина. К 1629 году упоминается также церковь святой мученицы Параскевы Пятницы с приделом святой Гликерии, уничтоженная пожаром в том же году. На месте сгоревших храмов остались два церковных места, посвящённых Спасу Нерукотворному Образу и Казанской иконе Божией Матери.
К 1646 году в селе существовал уже комплекс из трёх храмов: Живоначальной Троицы с приделами, Бориса и Глеба с приделами, и Параскевы Пятницы с приделами. Описание 1666 года свидетельствует о наличии шатровых завершений у Троицкой церкви и отдельно стоящей высокой шатровой Борисоглебской церкви. В храмах находились значительные святыни, включая иконы в серебряных басменных окладах, частицы мощей киевопечерских святых.
Каменный Троицкий храм в стиле классицизма был построен в 1838 году на средства прихожан. Четырёхстолпное пятикупольное здание с боковыми приделами Спаса Нерукотворного Образа и Казанской иконы Божией Матери возведено по образцовому проекту. Одновременно с ним существовала каменная Успенская церковь 1795 года постройки с четырьмя престолами, включая приделы во имя святых князей Бориса и Глеба и преподобного Онуфрия Великого.
В советский период храмовый комплекс был закрыт и пришёл в запустение. Реставрационные работы начались в конце XX века. Великое освящение восстановленного Троицкого храма совершено 15 июня 2024 года. В настоящее время храм является действующим и относится к Костромской епархии Русской Православной Церкви.
