В 1707 году на месте будущего Троицко-Печорска была построена деревянная церковь Живоначальной Троицы. В том же году селение стало погостом Кузьминским, насчитывая 9 дворов. Первая церковь Троицко-Печорского района была деревянной и называлась церковью Живоначальной Троицы; её построили около 300 лет назад.
В 1854 году началась перестройка церкви в каменную. Строительство продолжалось до 1862 года, и в День Святой Троицы храм открыл свои двери. Церковь была очень красивой, её высота доходила до 45 метров. На колокольне было 10 колоколов, на куполах блестели на солнце 4 креста.
Архитектором проекта был Н. Я. Черепанов. Белокаменное здание церкви было видно и слышно далеко, стоя на высоком берегу реки Печоры. С трёх сторон её окружало кладбище.
В январе 1934 года началось разрушение церкви. Здание было продано точильной фабрике Войю. Колокола были сброшены на землю, и только один сохранился. Стены разобрали, и в марте кирпич был перевезён на баржах. Многие иконы были сожжены.
В 1988 году силами верующих открылся молебный дом на берегу реки Мылва. В 1991 году епархия направила священника Иоанна для обслуживания молебного дома. В 1993 году молебный дом был освящён и назван Троицкой церковью.
В июне 1998 года была построена новая церковь Святой Троицы по проекту архитектора П. Резникова. Архитектор был уроженцем Троицко-Печорска и работал в Сыктывкаре.
