Первоначально, в 1859 году, в Красном Куте была возведена деревянная церковь, освящённая во имя Архистратига Божия Михаила. Этот храм стал важным религиозным центром для местных жителей, удовлетворяя их духовные потребности.
В начале XX века, примерно в 1908 году, в связи с ростом населения и увеличением числа прихожан, было принято решение о переносе деревянного храма ближе к центру села. После переноса здание обложили кирпичом, что придало ему большую прочность и улучшило внешний вид. После завершения этих работ храм был повторно освящён, но уже в честь Пресвятой Троицы. Отделочные работы продолжались до 1917 года.
После революционных событий 1917 года и установления советской власти, многие религиозные учреждения подверглись закрытию или перепрофилированию. Свято-Троицкий храм не стал исключением: он был закрыт, и в его помещении разместились различные учреждения, включая кинотеатр. В советский период здание храма использовалось не по первоначальному назначению, что привело к утрате многих его первоначальных архитектурных и декоративных элементов.
В начале 1990-х годов, в период возрождения религиозной жизни в России, здание храма было возвращено Русской Православной Церкви. Был зарегистрирован приход, и начались работы по восстановлению храма. В ходе реставрации были восстановлены основные архитектурные элементы здания, а также воссоздан интерьер, соответствующий канонам православной церкви.