Храм святого преподобного Герасима Иорданского в Купчине был возведен в 1906 году как деревянная церковь на каменном фундаменте. Инициатива строительства принадлежала местному крестьянскому обществу, которое в 1901 году обратилось за содействием к протоиерею Философу Орнатскому, гласному Санкт-Петербургской городской думы. Первоначальный проект каменного храма в русском стиле был разработан архитектором Германом Гриммом в 1904 году, но его реализация оказалась невозможной из-за недостатка средств.
Строительство осуществилось благодаря пожертвованиям купца первой гильдии Ивана Шустрова, выделившего 10 тысяч рублей с условием освящения храма во имя преподобного Герасима Иорданского в память о своем родственнике. Архитектурный проект деревянного храма выполнил Иван Соколов, а строительные работы велись под руководством инженера Василия Сарандинаки. Церковь была освящена 1 ноября 1906 года.
Храм располагался вблизи Царскосельской железной дороги и обслуживал жителей деревни Купчино и Средней Рогатки. В 1917 году при храме был образован самостоятельный приход. В 1938 году церковь официально закрыли, хотя богослужения, по свидетельствам, продолжались до начала Великой Отечественной войны. В военные годы здание было разобрано на топливо.
В 2010-х годах возникла инициатива восстановления храма. Было принято решение о строительстве каменной церкви по первоначальному проекту Г.Д. Гримма, однако на момент 2025 года реализация этого проекта остается в стадии планирования.