Храм Святого Духа в станционном посёлке Евсино относится к числу православных храмов, возведённых в Новосибирской области в конце XX — начале XXI века. Точная дата основания храма не зафиксирована в открытых источниках, однако архитектурные особенности здания указывают на типовой проект, характерный для данного периода. Здание выполнено в традициях русской церковной архитектуры с элементами современного строительства.
Исторических сведений о предшествующих культовых сооружениях на данном месте не обнаружено. Храм был построен как новый религиозный центр для жителей станции Евсино и близлежащих населённых пунктов. В архитектурном плане здание представляет собой однопрестольный храм с шатровой колокольней, что соответствует канонам строительства малых приходских церквей.
В 1990-е годы, в период возрождения православной жизни в России, в станционном посёлке начались регулярные богослужения, первоначально проводившиеся в приспособленном помещении. Строительство капитального здания храма было завершено в первые годы XXI века. Освящение храма в честь Сошествия Святого Духа на апостолов соответствует традиции наименования новых храмов в честь важных христианских событий.
Архивные документы Новосибирской епархии содержат упоминания о включении храма в состав Искитимского благочиния. В церковных ведомостях начала 2000-х годов храм фигурирует как действующий приход без статуса памятника архитектуры или истории. Отсутствие в храме старинных икон или церковной утвари свидетельствует о его принадлежности к числу новостроенных культовых сооружений.
В период с 2010 по 2020 годы храм претерпел ряд незначительных архитектурных изменений, связанных с расширением церковной территории и благоустройством прилегающей площади. Современное состояние здания соответствует стандартам строительства православных храмов в сельской местности, принятым в Новосибирской митрополии.