15 марта 2000 года архиепископом Краснодарским и Новороссийским Исидором была совершена закладка и освящение плиты на месте будущего храма. Строительство началось в 2001 году. В сентябре 2007 года были установлены малые купола, а в марте 2008 года — главный купол храма. 7 июля 2011 года епископом Ейским Германом был освящен нижний придел в честь Новомучеников и исповедников Российских. 23 октября 2011 года митрополитом Екатеринодарским и Кубанским Исидором и епископом Майкопским и Адыгейским Тихоном был освящен главный престол храма в честь Сошествия Святого Духа на апостолов.
Архитектурно храм выполнен в русском стиле и является украшением Комсомольского микрорайона. Здание белоснежного цвета с семью куполами, увенчанными крестами, придает ему величественный вид. Верхний, главный престол храма посвящен Святому Духу, а нижний — Новомученикам и исповедникам Российским.
В храме хранятся святыни, включая ковчег с мощами святых угодников Божьих, таких как первомученик архидиакон Стефан, преподобные Герман и Савватий Соловецкие, преподобная Ефросиния Полоцкая, благоверный князь Роман Угличский, святитель Лука Войно-Ясенецкий, преподобномученица великая княгиня Елисавета и благоверные князья Петр и Феврония. Также в храме находится икона святителя Димитрия Ростовского с частицей его мощей, написанная в Спасо-Яковлевом мужском монастыре города Ростова Великого.
Особое почитание среди прихожан имеет икона Божией Матери "Праворучица", расположенная на лицевой стороне левой колонны храма. Несколько лет назад икона обновилась: исчезла чернота, покрывавшая оклад и сам образ. Служители храма также отмечали случаи самовозгорания лампады перед иконой.
С 2005 года в День Святой Троицы в храме проводится ежегодный крестный ход вокруг Комсомольского микрорайона. При храме действуют воскресная школа, библиотека, социальное и молодежное служения.
