Храм святого апостола Фомы в городе Ахангаран относится к Ташкентской и Узбекистанской епархии Среднеазиатского митрополичьего округа Русской православной церкви. Первые упоминания о православной общине в Ахангаране связаны с 1992 годом, когда на местном кладбище была построена часовня для отпевания усопших. Часовня стала центром формирования общины, которая впоследствии обратилась к церковным властям с просьбой об учреждении прихода.
В 1996 году был назначен первый настоятель, а богослужения первоначально совершались в часовне на кладбище. Позднее приход получил здание бывшего заводского барака, которое было перестроено под храм. В 1998 году храм был освящен в честь апостола Фомы. Престольный праздник установлен на 19 октября — день памяти апостола.
Апостол Фома, по церковному преданию, проповедовал в странах Востока, включая регионы Средней Азии. В исторических источниках указывается, что он следовал по Великому шелковому пути через Самарканд и Ташкент. Это послужило основанием для посвящения храма в его честь, учитывая его роль в распространении христианства в регионе.
В 2020 году началась подготовка к строительству нового храмового здания. Был вырыт котлован, разработан проект, согласованный с церковными властями. Однако на момент 2025 года строительство еще не завершено, и богослужения продолжаются во временном помещении.
При храме действует звонница, известная как «Цветок», созданная в память об одной из прихожанок. Храм посещают от 25 до 60 человек в зависимости от дня недели и праздников. В будние дни количество прихожан составляет около 25–40 человек, в праздничные дни — до 60.