Деревня Усть-Тунгуска была основана в 1637 году. По вине сюда были высланы семь семей, которые жили в каменной часовне. Со временем часовня стала храмом святого Василия Мангазейского. Название деревни, очевидно, происходит от прежнего названия Ангары — Верхняя Тунгуска.
В 2014 году на месте утраченного храма было начато строительство нового деревянного храма во имя святого мученика Василия Мангазейского. Проект был разработан архитектором С.Г. Гончаровым. Храм представляет собой деревянное здание, выполненное в традиционном стиле русского деревянного зодчества.