Храм св. Макария Абердинского был основан в начале XXI века как приход Московского Патриархата в городе Абердин, Шотландия. Община образована по инициативе местных православных верующих, преимущественно выходцев из России, Украины и Прибалтики. Первая Божественная литургия совершена в феврале 2010 года в капелланском центре Абердинского университета.
Приход носит имя преподобного Макария Абердинского, святого VI века, который считается первым епископом в этом регионе. Исторические источники указывают на его миссионерскую деятельность среди пиктских племен в раннесредневековый период. Канонизация святого Макария совершена в Православной Церкви, хотя точные даты его жизни и деятельности остаются предметом научных дискуссий.
Богослужения первоначально проводились в университетских помещениях - капелланском центре и часовне Кингс Колледж. Расписание зависело от академического календаря: в учебные периоды протестантская община имела приоритет в использовании часовни, тогда как православные службы совершались преимущественно в каникулярное время.
Литургическая жизнь прихода характеризуется использованием церковнославянского языка как основного богослужебного языка. В приходской практике сохраняется традиционный устав совершения всенощного бдения и Божественной литургии согласно Типикону Московского Патриархата.
Административно приход относится к Сурожской епархии Русской Православной Церкви. Духовенство первоначально прибывало из других городов Великобритании, включая Манчестер и Глазго, для регулярного совершения богослужений. В организационном становлении прихода ключевую роль сыграла группа активных мирян, взявших на себя хозяйственные и административные обязанности.