Строительство храма началось между 2010 и 2013 годами.
Приход в Губерле был официально зарегистрирован в 2009 году. В 2010 году администрация села выделила земельный участок под строительство храма. 29 мая 2010 года священник Александр Трушин освятил поклонный крест на месте будущего строительства, что положило начало возведению храма.
В 2011 году началось непосредственное строительство: был заложен фундамент и возведены стены. Особое внимание уделялось использованию качественных материалов; средняя часть храма была построена из бревенчатого сруба, предоставленного благодетелем А. Мерзляковым.
16 октября 2012 года епископ Орский и Гайский Ириней возглавил чин освящения купола и подъема его на колокольню. В июне 2013 года в храме были уложены новые полы, проведено электричество, устроен алтарь, утвержден престол и установлены иконы. Первая Божественная литургия состоялась 24 июня 2013 года, в день Святого Духа.
Архитектурно храм представляет собой деревянное здание с характерными для русской церковной архитектуры элементами. Особое внимание уделено деталям фасада и внутреннему убранству, что отражает традиции иконописи и церковного декора.
В 2018 году состоялось освящение колоколов, отлитых на Уральском колокололитейном заводе «Пятков и К». 30 сентября 2018 года колокола были освящены, а 11 октября того же года, в день обретения святых мощей преподобномученицы великой княгини Елисаветы, храм был освящен митрополитом Нижегородским и Арзамасским Георгием.