Первоначально на территории санатория «Халила» была построена деревянная церковь во имя святого благоверного князя Александра Невского. Строительство велось в 1892–1893 годах по проекту архитектора Е. Л. Лебурде. Церковь была освящена 21 мая 1893 года. Здание представляло собой деревянную конструкцию на гранитном цоколе, выполненную в форме креста с пятигранным алтарём и папертью с крыльцом. Крыша имела острорёберную форму и завершалась луковичной главкой. Интерьер украшал двухъярусный иконостас из орехового дерева с образами Спасителя, Божией Матери и святых. Церковь отапливалась четырьмя изразцовыми печами. Однако спустя несколько лет после постройки здание сгорело.
В 1905–1907 годах на месте утраченной деревянной церкви была возведена новая каменная церковь во имя святого благоверного князя Александра Невского. Архитектурный проект был разработан архитекторами Ю. Ф. Бруни и А. В. Ф. Петцольдом. Здание было выполнено в традициях русской православной архитектуры, с использованием кирпича и камня. Церковь имела один купол и колокольню. Внутреннее убранство включало иконостас и настенные росписи.
После Октябрьской революции 1917 года территория, на которой находился санаторий «Халила», отошла к Финляндии. С 1925 по 1939 год церковь была переоборудована в лютеранскую кирху. В этот период были внесены изменения в архитектурный облик здания, соответствующие лютеранским традициям.
В 1944 году, после возвращения территории в состав СССР, здание церкви использовалось под различные хозяйственные нужды. В 1992 году церковь была возвращена Русской православной церкви. В 2006 году начались реставрационные работы, направленные на восстановление первоначального облика здания. В 2010 году церковь была приписана к Амвросиевскому скиту Оптиной пустыни.
