Каменная одноглавая церковь Спаса Нерукотворного Образа с тёплым приделом была построена в 1779 году на пожертвования прихожан. Иконостас был создан в 1795—1797 годах местным резчиком Фёдором Андреевичем Бухвостовым. С 1799 года по 1823 год в Иванькове находилась летняя резиденция ярославских архиепископов. В 1813 году придел во имя мученицы Евдокии был переосвящён в честь Покрова Божьей Матери. В первой половине XIX века, в результате перестроек, храм стал пятиглавым, тогда же была возведена колокольня. В 1888 году, в 900-летие крещения Руси, у церкви был установлен чугунный крест на каменной тумбе с религиозными изображениями и надписью. В ведомости 1915 года о церкви указано, что внутри она украшена стенной росписью, а снаружи — пятнадцатью живописными клеймами. Приход храма включал жителей Иванькова и соседних деревень — Брагино, Овинишково, Фрольцево, Очапки и других, и на 1915 год насчитывал 1376 человек.
В 1941 году храм был закрыт, иконы были сожжены внутри храма, здание переоборудовали под склад. После распада колхоза церковь начала разрушаться: в средней части, где ныне находится Покровский придел, обрушился свод, стены местами были разобраны до половины. Также была разобрана ограда кладбища, с которого были увезены все мраморные надгробья. В 1989 году храм передали Русской Православной Церкви, а в мае 1996 года архиепископ Ярославский и Ростовский Михей освятил Покровский придел, где до полного восстановления храма совершались богослужения.
