Храм во имя Всех Сибирских Святых в поселке Куйтун Иркутской области был основан в начале XIX века в связи с переселением на эти земли нижних чинов российской армии, обращенных в казаков. В тот период в Куйтунском районе были построены и освящены несколько церквей, включая Барлукскую, Уянскую и Куйтунскую. По данным исторических источников, в 1815 году в Куйтуне был освящен храм во имя пророка Илии с приделом в честь святителя Николая Чудотворца. К началу XX века приход насчитывал более 4300 прихожан.
В советский период, постановлением ВЦИК от 21 апреля 1934 года, храм был закрыт. Здание использовалось сначала как Дом обороны, затем как гараж. В 1946 году Иркутский облисполком принял решение о его разборке, однако в 1950-е годы оно еще сохранялось, будучи переоборудованным под клуб. К концу XX века первоначальное здание храма не сохранилось.
Возрождение приходской жизни в Куйтуне началось 3 июня 1992 года, когда после шестидесятилетнего перерыва здесь было совершено первое богослужение. 23 июня того же года, в день празднования Собора Сибирских святых, был официально учрежден православный приход. В 1999 году местная администрация выделила верующим здание бывшей районной инспекции Госстраха, где богослужения совершались до 2015 года.
24 мая 2009 года при въезде в поселок Куйтун состоялась закладка первого камня в основание нового храма Всех Сибирских Святых. Строительство деревянного здания завершилось в 2011 году, после чего начались отделочные работы. Первое богослужение в новом храме было совершено 12 апреля 2015 года, в день Светлого Христова Воскресения. Окончательное освящение храма состоялось 13 октября 2019 года, в неделю 17-ю по Пятидесятнице, в день памяти святителя Михаила, первого митрополита Киевского.