Село Большие Чапурники было основано около 1785 года переселенцами из Ярзовки Царицынского уезда Саратовской губернии. В 1817 году в селе был устроен деревянный молитвенный дом во имя Рождества Пресвятой Богородицы, а в 1847 году начато строительство деревянной церкви. Согласно сведениям на 1914 год, село являлось центром Больше-Чапурниковской волости Черноярского уезда Астраханской губернии, в нём имелось 495 дворов и проживало 2505 человек.
В советский период храм был закрыт, и здание использовалось в различных хозяйственных целях. В 1993 году, после длительного перерыва, в селе был образован приход Рождества Пресвятой Богородицы. Первоначально богослужения проводились в здании бывшей конторы, затем молитвенный дом был устроен в купленных четырёх вагончиках, соединённых вместе и отделанных благодаря стараниям местных жителей.
В настоящее время храм представляет собой одноэтажное здание с металлической обшивкой и синим скатным кровом. На крыше установлен небольшой купол с крестом. Рядом с храмом расположена звонница, для которой были отлиты колокола по специальному заказу. При храме действует библиотека, а также организованы помещения для отдыха прихожан.