Село Абганерово имеет богатую историю, уходящую корнями в XVIII век. В этот период в регионе активно развивалось земледелие и скотоводство, что способствовало росту численности населения и потребности в духовном окормлении. В связи с этим возникла необходимость строительства храма для проведения богослужений и религиозных обрядов.
Первоначально в селе была возведена деревянная церковь, посвященная Рождеству Пресвятой Богородицы. Деревянные храмы были распространены в то время из-за доступности строительных материалов и простоты возведения. Однако такие сооружения были подвержены воздействию времени и природных факторов, что приводило к их постепенному разрушению.
К началу XX века деревянная церковь пришла в ветхое состояние, и было принято решение о строительстве нового каменного храма на том же месте. Каменные храмы отличались большей долговечностью и устойчивостью к внешним воздействиям. Строительство нового храма осуществлялось на средства прихожан и местных благотворителей. В архитектурном плане здание представляло собой образец русско-византийского стиля с характерными элементами: куполами, арочными окнами и декоративными деталями.
В период советской власти, особенно в 1930-е годы, многие религиозные учреждения подвергались закрытию и разрушению в рамках антирелигиозной политики государства. Храм Рождества Пресвятой Богородицы в селе Абганерово не стал исключением. Здание было закрыто, а его помещения использовались для различных хозяйственных нужд, что привело к утрате многих элементов внутреннего убранства и архитектурных деталей.
После распада Советского Союза и изменения государственной политики в отношении религии в 1990-е годы начался процесс возвращения церковных зданий Русской Православной Церкви и восстановления религиозной жизни в регионах. В селе Абганерово местные жители проявили инициативу по восстановлению храма Рождества Пресвятой Богородицы. Благодаря усилиям прихожан и поддержке местных властей здание было отремонтировано и вновь освящено для проведения богослужений.