Храм Рождества Пресвятой Богородицы при Санкт-Петербургской государственной консерватории был основан как домовая церковь Императорского Русского музыкального общества. Здание храма построено в 1891–1896 годах по проекту архитектора Владимира Васильевича Николя в ходе перестройки здания бывшего Большого театра. Освящение храма совершено 31 октября 1896 года ректором Санкт-Петербургской духовной академии архимандритом Тихоном.
В 1900 году братья Чайковские заказали для храма образ святого апостола Петра в память о своем брате, композиторе Петре Ильиче Чайковском, выпускнике консерватории. В 1901 году протоиерей Иоанн Кронштадтский передал в дар храму серебряные богослужебные сосуды. В 1922 году храм был закрыт, а его утварь перенесена в Николо-Богоявленский морской собор.
Богослужебная жизнь возобновилась в пасхальную ночь с 26 на 27 апреля 1997 года. В настоящее время храм не имеет постоянного помещения. Богослужения совершаются в читальном зале консерватории на временном престоле, а также во временной часовне (учебном классе 24-а). Престольный праздник отмечается 21 сентября.
Архитектурные особенности храма включают сохранившиеся росписи на холстах, приклеенных к стенам, созданные художниками Андреем Рябушкиным и Виктором Беляевым. Росписи были закрашены в 1920-е годы и обнаружены в ходе реставрационных работ. Композиция включает изображение «О Тебе радуется», а также фигуру царя Давида с гуслями.
При храме действует библейская группа, проводятся евангельские чтения по средам. Община храма опекает школу-интернат №24, где находится домовая церковь во имя преподобного Сергия Радонежского. В этом храме приход участвует в совершении Евхаристии.