Село Коротни было основано русскими переселенцами из северных уездов не позднее 1661 года. В 1828 году на средства прихожан в селе была построена каменная церковь во имя Рождества Иоанна Предтечи, заменившая ранее существовавший деревянный храм. Новый двухпрестольный храм включал главный престол в честь Рождества Иоанна Предтечи и придел во имя Сретения Господня.
В 1849 году при храме была открыта церковно-приходская школа, которая с 1866 года перешла в ведение земства. В период советской власти храм был закрыт, и его здание использовалось для различных хозяйственных нужд, что привело к утрате многих архитектурных элементов и внутреннего убранства.
В конце XX — начале XXI века начались работы по восстановлению храма. Здание было возвращено Русской Православной Церкви, после чего проведены реставрационные мероприятия, направленные на восстановление первоначального облика храма и возобновление богослужений.