Храм в честь Рождества Христова в деревне Букишкис Вильнюсского района был основан в 1867–1868 годах. Строительство храма связано с именем генерала Павла Божерьянова, получившего имение Букишкес после подавления польско-литовского восстания 1863–1864 годов. Первоначально храм, предположительно освященный в честь Спаса Нерукотворного, выполнял функции домовой церкви при усадьбе Божерьянова.
Архитектурный облик храма характерен для православных церквей второй половины XIX века. Генерал Божерьянов был похоронен в семейной усыпальнице под храмом вместе с женой и дочерью. В 1950-х годах усыпальница была разграблена местными жителями, искавшими фамильные драгоценности, что привело к осквернению захоронений.
В советский период здание храма использовалось для хозяйственных нужд: в нем был установлен электродвигатель для освещения поселка, что вызвало повреждения конструкции из-за вибраций. В 1980-х годах обсуждался вопрос о ремонте здания с возможным последующим использованием в качестве музея атеизма, однако эти планы не были реализованы.
После восстановления независимости Литвы храм был возвращен Русской Православной Церкви. В настоящее время он принадлежит Виленской и Литовской епархии Московского Патриархата. Богослужения совершаются на церковнославянском языке по воскресным и праздничным дням.
Исторические источники указывают на активное участие прихожан в жизни храма с момента его основания. По свидетельствам старожилов, в XIX веке храм всегда был полон народа, что отчасти связывают с практикой материального поощрения прихожан со стороны владельца усадьбы.
