Строительство храма завершилось через год, и 24 июня 2000 года был совершен благодарственный молебен по случаю окончания работ.30 декабря 2000 года архиепископ Варнава освятил престол храма в честь Пресветлого Рождества Христа Спасителя.
Проект храма был подарен правительством Москвы и представляет собой модифицированную копию храма святых страстотерпцев Бориса и Глеба на Арбатской площади. Автором проекта является архитектор Н.Г. Емельянов. Здание представляет собой каменную одноглавую церковь-часовню с колокольней, расположенной по центру основного объема. В 2015 году внутренние стены храма были расписаны в византийском стиле.
С момента освящения и до 2009 года церковь Рождества Христова была приписана к Чебоксарскому Свято-Троицкому мужскому монастырю. В 2009 году храм получил статус епархиального, а с сентября 2015 года функционирует как приходской.
Одной из главных святынь храма является парсуна «Житие царевича Дмитрия Угличевского». Согласно преданию, появление этой иконы связано с именем Марии Шестовой, бабушки по матери первого царя из рода Романовых — Михаила Фёдоровича. В 1601 году, насильно постриженная царем Борисом Годуновым в инокини в Чебоксарском Никольском девичьем монастыре, бывшая княгиня Мария заказала иконописцам образ святого царевича Дмитрия Угличевского. С 2000 года икона-парсуна находится в храме Рождества Христова в Чебоксарах.
